1) Sắc tố diệp lục (Clorophyl): Có vai trò quan trọng nhất đối với quang hợp, vì sắc tố này có khả năng hấp thụ năng lượng ánh sáng mặt trời và biến năng lượng ấy thành dạng năng lượng hóa học để nuôi cây.
2) Sắc tố vàng (Carotenoid):
- Lọc ánh sáng, bảo vệ clorophyl khỏi bị hư hại dưới cường độ quá mạnh.
- Tham gia vào quá trình quang phân li nước và thải O2.
- Tham gia quá trình quang hợp bằng cách tiếp nhận năng lượng ánh sáng mặt trời và truyền cho clorophyl và nó có mặt trong hệ thống quang hóa II.
3) Sắc tố xanh (phicobilin): lượng tử ánh sáng do phicobilin hấp thụ sẽ được chuyển đến clorophyl để sử dụng cho quang hợp với hiệu suất cao, đảm bảo cây tận dụng tối đa nguồn sáng có được.